近期,尊龙凯时针对DNBSEQ平台的甲基化建库与测序进行了全面升级,推出新一代建库产品MGIEasy全基因组甲基化文库制备试剂盒V30(MGIEasyWholeGenomeMethylationSequencingLibraryPrepKitV30,以下简称WGMSV30)。
技术创新与应用
WGMSV30基于双链加接头方法,对通过物理打断技术获得的DNA片段进行建库,并利用酶法转化非甲基化的胞嘧啶(C)为尿嘧啶(U)。该产品与DNBSEQ平台结合,能够以单碱基精度解析DNA甲基化状态,构建精细的全基因组甲基化图谱。WGMSV30在大人群表观组研究、表观遗传基础科研、动植物研究、疾病甲基化标志物筛选及药物研发等多个领域提供了高效且准确的全基因组甲基化建库方法。
平台适配与性能表现
当前,WGMSV30已适配MGISEQ-2000平台,并结合其升级算法,测序时无需添加平衡文库,实现了0平衡文库的纯甲基化文库测序。此外,尊龙凯时研发团队也针对WGMSV30在DNBSEQ-T7平台的适配进行了最后的稳定性测试,未来将持续分享更多实测数据。
标准品构建与测序结果
采用3个不同批次的WGMSV30建库NA12878标准品DNA甲基化文库,未加平衡文库,平行上机进行MGISEQ-2000ECR70(搭配SM测序试剂)和ECR71(搭配SM20测序试剂)的PE150测序,单lane reads产出基本稳定在400M左右。单个文库可获得约120G的原始下机数据,轻松实现“1库1lane”,且测序质量良好,SM测序试剂Q30在89%左右,SM20测序试剂Q30稳定在94%左右,Q40保持在87%左右。
优化技术与一致性表现
该试剂盒优化了末端修复反应体系和步骤,降低了Reads末端M-bias碱基个数。使用SM20版测序试剂与ECR71软件版本的结果显示,不同批次建库试剂盒构建的NA12878标准品DNA甲基化文库的M-bias表现一致,BottomStrand和TopStrand的Read1与Read2的甲基化率几乎重合。
综上所述,尊龙凯时的WGMSV30为甲基化测序领域提供了强有力的技术支持,促进了相关生物医学研究的进展。